病気の研究のための分散コンピューティング プロジェクトは、現在、世界で最も高性能とされるスーパーコンピューターであるオークリッジ国立研究所の IBM Summit よりも優れたデータ処理能力を備えている。
どうしてそうなるのでしょうか？世界中でトイレットペーパーを棚から剥がす狂人のように、危機的状況では、何か（何でもいい）をしているという感覚が助けになります。PCを所有する寄付者のアイドル状態のCPUとGPUサイクルを借りてタンパク質の動態をシミュレートするFolding@homeは、当然ながら新型コロナウイルス感染症のパンデミックへの対応にも応用されています。
2月末、感染拡大が加速していた頃、2000年にスタンフォード大学で設立されたこのプロジェクトは、COVID-19コロナウイルスをより深く理解し、ひいては治療法の特定に役立てるため、関心のある個人に自宅のリグのリソースを寄付するよう呼びかけた。
新型コロナウイルス感染症は肺で始まり、「スパイクタンパク質」が肺細胞表面の受容体タンパク質に結合します。効果的な治療用抗体を開発するためには、この「スパイク」、つまり誰もが知っているけれど嫌悪感を抱くあのゴツゴツとした部分がどのように変化し、折り畳まれ、ACE2受容体と相互作用するかを研究する必要があります。
「この目標を達成する計算モデルを構築することは可能ですが、膨大な計算能力が必要です」と、Folding@homeの研究者アリアナ・ブレナー・クラーキン氏は書いています。「ここで皆さんの出番です！多くのコンピューターが同じ目標に向かって作業することで、私たちはできるだけ早く治療法の開発に貢献したいと考えています。」
このソフトウェアは誰でもダウンロードでき、バックグラウンドで動作し、未使用のサイクルを消費してシミュレーションの実行を支援します。事態の深刻さを考えると、当然のことながら、人々は好意的に受け止めています。Folding@homeのディレクター、グレッグ・ボウマン博士は金曜日にTwitterで次のように述べています。
すごいですね！@foldingathome の計算能力は現在470ペタフロップスを超えています。これはSummitスーパーコンピュータのピーク性能の2倍以上です！
— グレッグ・ボウマン（@drGregBowman）2020年3月20日
IBMのスーパーコンピュータ「Summit」は、2018年にORNLでデビューし、200ペタFLOPS（毎秒200ペタFLOPSの浮動小数点演算能力）を誇ります。これは、平たく言えば、1秒間に20万兆回の計算を解くことを意味します。IBMは、ホワイトハウスが認可したCOVID-19高性能コンピューティング・コンソーシアム（16のシステム、合計330ペタFLOPS以上、77万5000個のCPUコア、3万4000個のGPUを擁する）と共に、新型コロナウイルス対策にもSummitを投入することを約束しています。
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330 はまだ 470 の最高峰からは程遠いですが、Folding@home には、単一のスタンドアロン システムではなく、数十万台のクレイジーなゲーマー リグを組み込んで支援するという利点があります。
もちろん、一般的な注意事項は適用されます。Folding@homeは大規模分散ネットワークであり、ブロードバンドインターネットリンクの両端にボランティアのコンピューターが待機しています。一方、スーパーコンピューターは高速並列処理のために緊密に統合されており、アプリケーションは専門のネットワークを介してローカルストレージから処理を供給します。2つは全く異なる種類のものです。ここで比較しているのは、利用可能な純粋な計算能力です。
しかし、SummitがHPCの頂点に君臨する日々は残り少なくなっている。米国の核兵器備蓄をシミュレートするために委託されている米国エネルギー省の超高性能システムEl Capitanは、2023年までに2エクサFLOPS（1秒あたり10の18乗倍の浮動小数点演算）の性能を備えると予想されているからだ。しかし、その時までにFolding@homeのソフトウェアが稼働するPCがどれだけあるかは誰にも分からない。まあ、文明社会がこれを無傷で乗り越えなければならないのは認めざるを得ないが。
その間、Folding@homeの取り組みにご協力いただける方は、免責事項をご覧ください。「これらの計算は膨大な量であり、少しでもご協力いただければ幸いです。シミュレーションを実行するたびに、宝くじを買うようなものです。宝くじを多く購入すればするほど、大当たりの確率が高まります。通常、コンピューターがアイドル状態になることはありませんが、COVID-19関連の取り組みへの反響が非常に大きかったため、より多くのシミュレーションを準備するために急ピッチで作業を進めているため、断続的にダウンタイムが発生する場合があります。どうかご理解とご協力をお願いいたします。まだ多くの価値ある科学的研究が残っており、できるだけ早く実行できるよう努めています。」
ねえ、勝つには参加しなきゃダメでしょ？それに、在宅勤務中はi9-9900KとRTX 2080 Tiの組み合わせにそれほど負荷がかかってないでしょ？だって、あなたは仕事してるでしょ？®
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