皆さん、自分を褒めてあげてください。Register の読者で構成された 2 つのチームが、病気研究のための Folding@home 分散コンピューティング プロジェクトで、250,000 を超えるチームのうち上位 1,000 位以内に入っています。
このネットワークは約20年にわたり、さまざまな病気に関係するタンパク質の折り畳みをシミュレートするために使用されてきたが、2月末、このプロジェクトの科学者らは、現在世界中で猛威を振るい、私たち全員を眠い目と引きこもり状態にしている新型コロナウイルスによって引き起こされる、潜在的に致命的な呼吸器感染症であるCOVID-19と戦うためにリソースを提供すると発表した。
The Register がこの記事を取り上げたのは 3 週間前で、Folding@home の計算能力が 470 ペタ FLOPS に達し、世界で最も強力な (公表されている) スーパーコンピューターであるオークリッジ国立研究所の IBM Summit を上回ったときだった。
PCオーナーたちは、コロナウイルスの治療法を求めて、史上最強のコンピューターに飛び込んでいる。
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これは全く同じ比較ではありません。Folding@home は大規模に分散されたネットワークで、ブロードバンド インターネット リンクの端にボランティアのコンピューターが作業を待機しています。一方、スーパーコンピューターは、アプリケーションが専門のネットワークを介してローカル ストレージから作業を供給し、高速な並列処理のために緊密に統合されています。しかし、このようなときには、私たち全員がちょっとした「良いニュース」を楽しみます。
読者の皆さんは、余ったCPUやGPUサイクルをこの活動に喜んで寄付してくれたようです。コメント投稿者たちは、The Regの死肉をむさぼるマスコットにちなんで名付けられた「Folding Vultures」チームを素早く結成しました。それからわずか1ヶ月で、Folding Vulturesは250,341チーム中883位にランクインし、過去50日間で549個のCPUがアクティブになっています。
しかし、それだけではありません。2007年には、Grid.orgを通じてがん研究に取り組む分散コンピューティング・プロジェクトが閉鎖された後、VultureベースのFolding@homeチームが新たに設立されました。この13年間、ひっそりと活動を続けてきたVulture Central 2.2は、現在713位というさらに立派な順位を維持しています。ポイントとランキングの計算方法について詳しくはこちらをご覧ください。また、上位チームについてはこちらをご覧ください。
家庭用PCを活用して現在の脅威に少しでも対処できる可能性は明らかに魅力的であり、Folding@homeで利用可能な計算能力は飛躍的に向上しました。Summitを制覇してから1週間後、ネットワークはエクサスケールとなり、1.5エクサFLOPS（1秒あたり1,500,000,000,000,000,000回の浮動小数点演算）を超えました。現在はどうなっているのでしょうか？公式統計を見てください。2.4 EFLOPSです。
私たちの総合的な力により、現在約2.4エクサフロップス（上位500台のスーパーコンピュータを合わせたよりも高速）を実現しています！IBM Summitのような、数千台のGPUを一度に使って短い計算を実行するスーパーコンピュータを補完し、より長い計算を小さなチャンクに分割して世界中に分散させることで実現しています！ pic.twitter.com/fdUaXOcdFJ
— Folding@home (@foldingathome) 2020年4月13日
ウイルス研究プラットフォームは、表現を間違えなければ、ウイルスのように消滅しました。
これを大局的に見ると、サミットの座を奪った El Capitan (米国の核兵器備蓄をシミュレートするために委託された米国エネルギー省のスーパーコンピューター) は、単体で少なくとも 2 EFLOPS の性能があるはずなのに、まだ稼働すらしていない。
一方、日本は最新のスーパーコンピュータである富士通の400PFLOPS（ペタフロップス）「富岳」を用いて、新薬と既存薬が新型コロナウイルスとどのように相互作用するかを研究し、適切な治療法の発見を目指しています。米国も、Google、Microsoft、Amazon、HPE、そしてもちろんIBMを含むコンソーシアムを通じて同様の研究を行っていると言われています。
しかし、タンパク質の動態シミュレーションに必要な計算量は膨大であり、これらのマシンが一夜にしてCOVID-19を魔法のように治すわけではないことを付け加えておく必要があります。Folding@homeチームは、シミュレーションの実行を宝くじの購入に例えています。つまり、より多くの人が実行すればするほど、プロジェクトが重要な発見につながる可能性が高まるということです。しかし、いずれにしても、余ったサイクルが無駄になるわけではありません。重要な科学研究は常に行われており、このネットワークによって実現された多くの査読済み論文は、こちらでご覧いただけます。
私たち全員が「エッセンシャルワーカー」になれるわけではありません。医療サービスやスーパーマーケットでボランティア活動ができるわけでもありません。でも、きっと皆さんの中には、きっと素晴らしいツールを持っている人がいるはずです。クライアントをダウンロードして、余剰リソースの一部を寄付することはできるはずです。Regの読者が力を合わせれば、どれほどの成果をあげられるか、まさにその証です。®
